Гистондеацетилаза 3 (англ. Histone deacetylase 3) — фермент, кодируемый у человека геном HDAC3 .
Функция
Гистоны играют важнейшую роль в регуляции транскрипции, клеточного цикла и процессов развития. Ацетилирование/деацетилирование гистонов изменяет структуру хромосом и влияет на доступ факторов транскрипции к ДНК. Белок, кодируемый этим геном принадлежит семейству гистондезацетилаз/acuc/APHA. Он имеет функциональность гистондеацетилазы и подавляет транскрипцию, когда связан с промотором. Он может участвовать в регуляции транскрипции путём связывание с фактором транскрипции цинковый палец YY1 . Этот белок также может негативно регулировать функцию p53 и, таким образом, модулировать рост клеток и апоптоз. Этот ген рассматривается в качестве потенциального гена-супрессора опухоли.
Этот фермент участвует в координации синантропного бактериально-зависимого кишечного гомеостаза при экспрессии в эпителиальных клетках кишечника.
Альтернативные функции
Гистондезацетилазы могут регулировать с помощью эндогенных факторов, биологически активных компонентов, синтетических ингибиторов и бактериально полученных сигналов. Исследования на мышах с определенной делецтией HDAC3 в эпителиальных клетках кишечника (IEC) показали экспрессию гена дерегулированных IEC. В этих делециях мутантных мышей, наблюдались потеря клеток Панета, нарушение функции IEC и изменения в составе кишечных комменсальных бактерий. Тот факт что эти негативные эффекты не наблюдались у стерильных мышей, указывает на то, что эффекты делеции видны только в присутствии кишечной микробной колонизации. Но негативные последствия делеций HDAC3 происходят не из-за наличия измененного микробиоценоза, потому что колонии нормальных стерильных мышей с измененной микрофлорой не показали негативных эффектов, наблюдаемых у делеционных мутантов.
Хотя точный механизм и специфика сигналов не вполне понятны, ясно что HDAC3 взаимодействует с полученными сигналами синантропных бактерий кишечной микрофлоры. Эти взаимодействия ответственны за калибровки откликов эпителиальных клеток в плане необходимости установки нормальных отношений между хостовыми и синантропными клетками, а также для поддержания кишечного гомеостаза.
Модельные организмы
Модельные организмы были использованы при исследовании функций HDAC3. Условная линия нокаутных мышей, называемая Hdac3tm1a(EUCOMM)Wtsi была создана в рамках программы международного Консорциума нокаутных мышей, проектом мутагенеза с высокой пропускной способностью генерирации и распространения животных моделей болезней заинтересованным ученым.
Мужские и женские особи проходили стандартизированный фенотипический скриннинг для определения последствий делеции.
Двадцать шесть тестов проводились на мутантных мышах и наблюдались два существенных нарушения. Не было гомозиготных мутантных эмбрионов определено во время беременности, и в отдельных исследованиях ни доживали до конца лактации. Остальные тесты были проведены на гетерозиготных мутантных взрослых мышах; никаких существенных отклонений не наблюдались у этих животных.
Взаимодействия
HDAC3, как было выявлено, взаимодействует с:
- CBFA2T3,
- CCND1,
- GATA1,
- GATA2,
- GPS2,
- GTF2I,
- HDAC4,
- HDAC5,
- HDAC7,
- HDAC9,
- MAP3K7IP2,
- MAPK11,
- NCOR1,
- NCOR2,
- PPARD,
- PPARG,
- PML
- RBBP4,
- RELA,
- RP,
- RUNX2,
- SUV39H1,
- TCP1,
- TBL1X,
- TR2,
- Убиквитин C,
- YY1, и
- ZBTB33.
См также
- Деацетилазы гистонов